不想三天之后月黑风高的晚上，十多名蒙面闯入穆家，将穆家三十八口斩杀。亏得穆老爷的好友半夜到访，才将穆小兰救出。穆老爷的好友见穆小兰身负大仇，便带着她来到附近的黑木崖申冤。光明左使方恨天见穆小兰报仇心切，便以代其报仇为条件，逼其下嫁于己。此时的穆小兰无依无靠，只好答应。不想成婚洞房之日，竟发现入得洞房的居然是方恨天的弟子洪摇鹤，然而次日，方恨天竟当此事毫无发生一般，在众人面前与穆小兰假装琴瑟在御,莫不静好，可是一到晚上床地之事，又是那个洪摇鹤。
穆小兰质问方恨天，不想方恨天恼羞成怒，让她莫管此事，只需按部就班照做便可，如将此事吐露出去，便将其挫骨扬灰。穆小兰为求活命，只得忍辱负重。如此一般，又过数年，穆小兰终得其委。原来，当初任我行杀了东方不败并将葵花宝典毁去，不想东方不败早已将葵花宝典另行抄录，并藏于一秘密之所，方恨天不知因何得到了葵花宝典的抄本。
得到葵花宝典的方恨天自认为此乃天命所归，雄心大起，决意领袖群伦，奴役江湖，推翻朝廷，登基大宝。方恨天又知向问天必会横加阻拦，一狠之下，便将向问天偷偷杀害，让傀儡假扮教主，替其发号施令。随后，方恨天挥刀自宫，开始修炼天下至邪武学葵花宝典，并用三尸脑神丹控制天下武学高手为其效力，准备一统天下。便在此时，教中传出方恨天可能重修葵花宝典，方恨天为堵众人口舌，于是与穆小兰成婚来遮人耳目。
方恨天更是不惜让其弟子洪摇鹤代其行男女之事，意欲让穆小兰怀孕，以此来彻底粉碎教中传言。方恨天虽勤于修炼葵花宝典，但却始终无法做到心无杂念，超然物外，男女互化。偶然之下，方恨天听闻到“紫霞秘笈，入门初基，葵花宝典，登峰造极”十六字真言，心中暗喜。华山掌门施戴子与劳德诺本是左冷禅昔日同派往华山的卧底，如今，左冷禅已死，劳德诺已疯，自己奸细身份自然无人所知。
不想此秘密之事，早已被日月神教造册再录，方恨天自会用此事要挟施戴子令其交出紫霞秘笈。身为掌门的施戴子不愿将自己曾为卧底之事公之于众，于是便将紫霞秘笈乖乖双手奉上，献给方恨天。数月前，穆小兰偶然得知昔日斩杀穆家上下蒙面人的竟是方恨天所派，对其之恨更是咬牙切齿，本想与之同归于尽，不想竟发现自己已有了身孕，母性使然，决定另想其法。
便在此时，与穆小兰私交甚好的丐帮帮主解风，暗中传言，昔日隐居江湖的一代高人风清扬好像重出江湖，可以向其寻求帮助。穆小兰不知风清扬心中所想，便以此种方法将其邀请而来，并央求风清扬能为己报仇，除掉方恨天。风清扬早有平息武林纷争之心，除掉方恨天自是与己不谋而合。风清扬手持长剑，怀揣穆小兰所授的魔教通行令牌，往黑木崖直奔而来，一路通过了魔教数十个关卡，终于到了黑木崖崖顶。
待到风清扬进入富丽堂皇的魔教大殿，看到一身红色锦衣，身形魁梧的虬髯大汉，端坐于大殿之上，便知此人便是方恨天。那方恨天猛见生人现于日月神教总坛，便知其乃泛泛之辈，飞身跃起，一掌拍向风清扬。两人虽有数丈，风清扬已感觉到方恨天掌力恐怖，随即侧身避开，长剑直指方恨天小腹。岂料，方恨天竟伸手捉住了风清扬的长剑。
风清扬心中一惊，知他手上戴有金丝手套，用力一抽，长剑从方恨天手中滑出。之后，风清扬长剑一挑，刺中方恨天身上的京门穴，没料到长剑竟刺不进其体内，竟成曲尺之状。风清扬心中大骇，知他身上穿有宝甲。眼见逼近地方恨天，风清扬招招刺向方恨天的眼睛。果然，方恨天伸手去挡，转眼两人已斗了百余招。风清扬感觉方恨天内息渐乱，正在暗暗高兴之时，方恨天不知手中竟多了把长剑，动作迅捷诡异，急攻而来。
风清扬反守为攻，刷刷两剑逼退方恨天，心念甫动之下，悟出了方恨天剑招破绽，随意出招，招招不离方恨天双眸。如此又是百招，风清扬知道方恨天身上有宝甲护身，一时也奈何不了，心中着急之时，不想，不知从何处窜出的穆小兰，痛斥方恨天已和东方不败一样，挥刀自宫，男女互化。方恨天心中迟疑之时，只见风清扬长剑一挥，方恨天双眼留下血线，横过面颊，直挂下颊，风清扬随即一剑刺中其颈部，方恨天立时倒地毙命。
魔教中人见方恨天已死，纷纷作鸟兽散，逃命而去，日月神教也随即分崩离析。至于方恨天的弟子洪摇鹤远赴神龙岛，创立神龙教，其后代洪安通又从三尸脑神丹改造出更为神奇的豹胎易筋丸，那都是后话了。数月之后，穆小兰生下一子将其委托风清扬收养之后，自刎而亡。风清扬见天下又归于太平，重上华山。那施戴子见得风清扬之后，战战兢兢。
